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人工智能助力酶設(shè)計(jì)突破:成功設(shè)計(jì)可催化復(fù)雜反應(yīng)的全新酶

   日期:2025-02-18     來源:IT之家     評論:0    
標(biāo)簽: AI 科技 創(chuàng)新

IT之家 2 月 17 日消息,據(jù) GeekWire 報(bào)道,由諾貝爾獎得主大衛(wèi)?貝克爾領(lǐng)導(dǎo)的華盛頓大學(xué)研究團(tuán)隊(duì)正在利用 AI 從零開始設(shè)計(jì)有效的酶,這項(xiàng)成就被研究人員視為“科學(xué)中的一項(xiàng)巨大挑戰(zhàn)”。

據(jù)IT之家了解,酶是自然界中的“魔法師”,它們能夠在溫和條件下迅速加速化學(xué)反應(yīng),并改變分子的結(jié)構(gòu)。酶存在于所有生物體的細(xì)胞中,是生命必不可少的組成部分。目前,酶已經(jīng)在藥物生產(chǎn)和工業(yè)過程中得到應(yīng)用。新開發(fā)的酶設(shè)計(jì)工具有望推動更廣泛的應(yīng)用領(lǐng)域。

貝克爾實(shí)驗(yàn)室的博士畢業(yè)生安娜?勞科表示:“現(xiàn)在,理論上我們能夠制造出針對任何反應(yīng)的定制酶?!彼a(bǔ)充道:“這簡直顛覆了我們過去設(shè)計(jì)酶的方式?!?/p>

去年,貝克爾獲得諾貝爾化學(xué)獎,表彰他在揭示蛋白質(zhì)分子結(jié)構(gòu)和開發(fā)利用 AI 設(shè)計(jì)新蛋白質(zhì)技術(shù)方面的開創(chuàng)性貢獻(xiàn)。

過去,科學(xué)家們通常通過拼接現(xiàn)有蛋白質(zhì)的成分來設(shè)計(jì)酶,期待這些拼接的部分能完成特定任務(wù)。然而,酶往往需要完成更精細(xì)的工作,它們在處理分子時(shí)需要多次改變形態(tài)。

華盛頓大學(xué)的研究團(tuán)隊(duì)選用了絲氨酸水解酶這種已經(jīng)研究得非常透徹的酶。該酶能夠切割許多含碳分子中的重要化學(xué)鍵,這些分子包括塑料、聚酯和人體內(nèi)的一種常見脂肪。

研究人員使用了貝克爾實(shí)驗(yàn)室開發(fā)的 RFdiffusion 模型,這是一款開源的蛋白質(zhì)生成 AI 程序,并與一個(gè)名為 PLACER 的新工具結(jié)合,幫助篩選出最有潛力的從零開始設(shè)計(jì)的酶。然后,團(tuán)隊(duì)測試了這些機(jī)器生成的酶的性能。

佩洛克表示:“它們還不如天然酶表現(xiàn)得好,但這些酶是計(jì)算機(jī)生成的,已經(jīng)是目前為止最優(yōu)秀的,并且非常精確?!?/p>

這項(xiàng)成就標(biāo)志著一個(gè)重要進(jìn)展,證明研究人員已接近開發(fā)出能夠執(zhí)行人類任務(wù)的新型酶,且這些酶的表現(xiàn)可能超越大自然中的天然酶

杉田目前正在研發(fā)一種酶,旨在幫助降解地球上堆積如山的塑料廢料。由于塑料是一種在進(jìn)化歷史上非常新的物質(zhì),酶還沒有足夠的時(shí)間進(jìn)化出能夠降解它們的能力。

雖然絲氨酸水解酶家族中有一種酶能夠切割塑料的化學(xué)鍵,幫助處理如水瓶等塑料制品,但地球上還有許多其他類型的塑料需要以可持續(xù)的方式降解。


 
 
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