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星艦基因與清華合作 中國(guó)首個(gè)人工智能深度挖掘基因數(shù)據(jù)庫(kù)研究

   日期:2016-08-02     來(lái)源:光明網(wǎng)    作者:XZJ     評(píng)論:0    
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   近日,星艦基因與清華大學(xué)生物信息實(shí)驗(yàn)室在北京達(dá)成戰(zhàn)略合作協(xié)議,雙方從生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)的云計(jì)算、基因數(shù)據(jù)庫(kù)開(kāi)發(fā)、應(yīng)用人工智能挖掘分析高通量數(shù)據(jù),人才引進(jìn)等多方面進(jìn)行深入合作,共同促進(jìn)生物信息技術(shù)在健康服務(wù)和精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域的應(yīng)用和發(fā)展,最終把科研成果運(yùn)用到人類(lèi)疾病的研究和治療中。
 
  “清華大學(xué)生物信息學(xué)實(shí)驗(yàn)室是中國(guó)頂尖的生物信息學(xué)研究機(jī)構(gòu),擁有世界領(lǐng)先的技術(shù)和科研人才;星艦基因是中國(guó)首家集人工智能技術(shù)與創(chuàng)客精神于一體的互聯(lián)網(wǎng)基因檢測(cè)公司,此次雙方的合作將促成國(guó)內(nèi)首個(gè)人工智能深度學(xué)習(xí)技術(shù)在基因組學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用。”星艦基因ceo莊滿生如是說(shuō)。
 
  目前國(guó)內(nèi)的基因檢測(cè)行業(yè)普遍開(kāi)始引入基因大數(shù)據(jù)和精準(zhǔn)醫(yī)療的概念,即通過(guò)收集到海量的dna信息,經(jīng)過(guò)歸納計(jì)算,就有可能總結(jié)出這些特征的發(fā)生規(guī)律,甚至總結(jié)出疾病發(fā)生規(guī)律。理論上看這對(duì)未來(lái)精準(zhǔn)醫(yī)療的貢獻(xiàn)是巨大的。
 
  可實(shí)際應(yīng)用中卻存在一些問(wèn)題:人類(lèi)發(fā)展到今天,dna突變總量數(shù)以?xún)|計(jì),現(xiàn)有技術(shù)只對(duì)突變頻率大于1%的部分進(jìn)行研究解析。這本身就需要巨大的患者樣本量才能統(tǒng)計(jì)出與正常人群體突變基因的差異。對(duì)于突變頻率小于1%的部分,群體數(shù)量仍然是龐大的,但由于沒(méi)有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,在現(xiàn)有疾病分析中就被自動(dòng)屏蔽掉了?;驒z測(cè)如果缺少對(duì)這部分突變的深入分析,可以說(shuō)精準(zhǔn)醫(yī)療只能被限制在狹小的范圍之內(nèi)。并且生命是多維度的、系統(tǒng)性的過(guò)程,除了在dna基因組層面外,我們將應(yīng)用大數(shù)據(jù)和人工智能的方法,以前所未有的“分辨率”來(lái)研究與人類(lèi)健康相關(guān)的每一個(gè)細(xì)節(jié)。
 
  星艦基因的思路就是引入人工智能的深度學(xué)習(xí)技術(shù),通過(guò)整理海量dna測(cè)序數(shù)據(jù),通過(guò)機(jī)器模擬人腦對(duì)信息的學(xué)習(xí)和處理過(guò)程,充分挖掘出全部樣本的數(shù)據(jù)價(jià)值,從而實(shí)現(xiàn)真正意義上的個(gè)性化精準(zhǔn)醫(yī)療。
 
  來(lái)自清華大學(xué)生物信息學(xué)實(shí)驗(yàn)室的研究員魯志博士稱(chēng),目前已于星艦基因共建研究團(tuán)隊(duì)。該團(tuán)隊(duì)的研究包括建立數(shù)學(xué)模型,然后輸入健康人的全基因組序列和rna序列,對(duì)模型進(jìn)行訓(xùn)練,使模型學(xué)到健康人的rna剪切模式;借著通過(guò)其他分子生物學(xué)方法對(duì)訓(xùn)練后的模型進(jìn)行確認(rèn)和校正;最后使用幾個(gè)目前已知的病例數(shù)據(jù),檢驗(yàn)?zāi)P团袛嗟臏?zhǔn)確性。“如果模型的深度學(xué)習(xí)分析變得足夠精確,這項(xiàng)技術(shù)對(duì)于直接分析突變頻率低的變異與疾病的關(guān)系,和加速基因組學(xué)研究與藥物開(kāi)發(fā)的貢獻(xiàn)將是巨大的。”魯志博士說(shuō)。
 
  目前該合作團(tuán)隊(duì)的技術(shù)還只能分析基因突變頻率大于1%的部分,以及引起的rna可變剪切與疾病的關(guān)系,對(duì)于其他原因?qū)е碌募膊∵€在研究中。但即便如此,人工智能在基因組學(xué)分析中的應(yīng)用仍值得期待,也許它會(huì)成為解碼基因與疾病奧秘的一把金鑰匙。
 
 
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