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UCLA研發(fā)微型鐵磁機(jī)器人自動(dòng)化微流體平臺(tái),實(shí)現(xiàn)高效自動(dòng)病毒檢測

   日期:2023-01-04     來源:DeepTech深科技     評(píng)論:0    
  最近,在香港大學(xué)機(jī)械工程系科研助理教授林海松擔(dān)任第一作者的Nature論文中,他和合作者利用名為Ferrobot的微型鐵磁機(jī)器人,實(shí)現(xiàn)了自動(dòng)化的快速群組病毒檢測,可使檢測試劑成本下降10至300倍。

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圖|林海松(來源:林海松)
 
  在這一技術(shù)中,10個(gè)Ferrobot微型機(jī)器人高效協(xié)作,它們攜帶著輸入的鼻咽拭子樣品,在手掌大小的平臺(tái)上進(jìn)行自動(dòng)化運(yùn)輸、分離、分類、混合等操作,通過集成核酸擴(kuò)增檢測試劑,來對(duì)新冠病毒的遺傳物質(zhì)進(jìn)行群組篩查,從而對(duì)病毒感染情況進(jìn)行診斷。

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圖|只有手掌大小的Ferrobot檢測平臺(tái)(來源:Nature)
 
  其與實(shí)驗(yàn)室檢測的聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)測試法(即大家熟悉的核酸檢測),所得到的結(jié)果一致。同時(shí),F(xiàn)errobot平臺(tái)的制造成本既廉價(jià)、又簡單,可以實(shí)現(xiàn)大規(guī)模生產(chǎn)和部署。整個(gè)系統(tǒng)的運(yùn)行可靠性,遠(yuǎn)超諸多同類型的流體操縱技術(shù),并在800多萬次自動(dòng)化測試中得到了證明。
 
  同時(shí),它的另一突破在于:利用基于患病率的適應(yīng)性檢測算法——平方矩陣方案,進(jìn)行群組篩查。在同時(shí)測試16個(gè)樣品的前提下,相比單獨(dú)測試的方法,該技術(shù)的微量化測試與群組篩查設(shè)計(jì)的特點(diǎn),能讓化學(xué)試劑的消耗量降低300倍。
 
  如果群組測試結(jié)果為陽性,后續(xù)的篩查測試將繼續(xù)由該平臺(tái)自動(dòng)進(jìn)行,直到識(shí)別出具體的陽性樣本。測試全程只需30到60分鐘,具體時(shí)長取決于是否有陽性樣本。
 
  圖|基于患病率的適應(yīng)性平方矩陣檢測算法及硬件執(zhí)行方案,可對(duì)16個(gè)樣本進(jìn)行全自動(dòng)群組篩查(來源:Nature)
 
  此外,只有手掌大小的便攜式平臺(tái)利用可編程的自動(dòng)化操縱,可以避免繁瑣的人工操作,從而縮短測試周期。在自動(dòng)化分析中,無需過多的專業(yè)測試人員,就能在大規(guī)模測試點(diǎn)和社區(qū)實(shí)現(xiàn)自主檢測。
 
  舉例來說,幾十個(gè)檢測組件就有望實(shí)現(xiàn)對(duì)一所大學(xué)進(jìn)行快速病毒檢測。同時(shí),這款手持式一體化實(shí)驗(yàn)平臺(tái),可以讓病毒檢測脫離實(shí)驗(yàn)室的局限性,從而實(shí)現(xiàn)檢測的社區(qū)化普及,進(jìn)而最大限度地利用資源,降低物資和人力的使用量,借此減少測試成本,同時(shí)還能有效遏制疫情蔓延。
 
  也就是說,F(xiàn)errobot平臺(tái)能對(duì)新冠病毒進(jìn)行快速、廉價(jià)的自動(dòng)化檢測,而且無需繁瑣的樣品處理和復(fù)雜的人員培訓(xùn)。在芯片中,樣本會(huì)被進(jìn)行自動(dòng)化處理分析,從而減少對(duì)于實(shí)驗(yàn)室規(guī)模集中檢測的依賴,可以輕易地在辦公樓、學(xué)校、機(jī)場甚至公共交通上部署病毒測試。
 
  而這種無需實(shí)驗(yàn)室分析的方法,在便攜快速的同時(shí)還能保障檢測的精準(zhǔn)度。此外,基于微流控的測試對(duì)試劑的消耗較少,可以極大地降低測試所需成本。

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(來源:Nature)
 
  事實(shí)上,在每一種新型病毒爆發(fā)的初期,對(duì)病毒的追蹤速度直接關(guān)系到疫情的傳播速度,測試方法的較長研發(fā)周期,也會(huì)直接導(dǎo)致疫情的快速蔓延。
 
  而Ferrobot平臺(tái)能對(duì)新病毒的特定核酸信息進(jìn)行“身份識(shí)別”,從而實(shí)現(xiàn)快速部署,借此建立準(zhǔn)確的病毒檢測方法,進(jìn)而及時(shí)控制傳播鏈。
 
  此外,對(duì)于人體生物液中的多種生物標(biāo)記,其也具備實(shí)時(shí)分析的潛力。除能對(duì)病毒性疾病進(jìn)行檢測追蹤,還可以集成多種類型的生物試劑和傳感器,幫助人們更好地進(jìn)行健康管理,以及協(xié)助醫(yī)生檢查患者的健康狀態(tài)。
 
  另據(jù)悉,研究團(tuán)隊(duì)也打算探索該系統(tǒng)在化學(xué)、材料領(lǐng)域的應(yīng)用。由于Ferrobot微流控芯片系統(tǒng)具備高度集成的特質(zhì),可以實(shí)現(xiàn)多種快速液體操縱,因此課題組希望借此解放實(shí)驗(yàn)室中人員的雙手,通過編程合適的反應(yīng)流程,利用微流控系統(tǒng)對(duì)反應(yīng)過程實(shí)現(xiàn)準(zhǔn)確、安全的控制,并結(jié)合算法來快速探索未知的反應(yīng)。
 
  當(dāng)然,該平臺(tái)的應(yīng)用場景,絕不限于新冠病毒這一種病毒。過去幾十年間,包括新冠病毒在內(nèi)的多種流行病毒,頻繁且規(guī)律性的出現(xiàn)威脅著人類的健康。
 
  在控制病毒大面積爆發(fā)的過程中,及時(shí)的病毒檢測至關(guān)重要。然而,現(xiàn)有的檢測模式高度依賴實(shí)驗(yàn)室設(shè)備,需要將待測樣本從各個(gè)檢測點(diǎn)收集、統(tǒng)計(jì)、運(yùn)輸?shù)教囟▽?shí)驗(yàn)室進(jìn)行分析,這會(huì)消耗大量的人力財(cái)力,并且耗時(shí)也比較長。因此,我們亟需一款便攜、廉價(jià)的檢測設(shè)備。
 
  據(jù)介紹,F(xiàn)errobot檢測平臺(tái)的研發(fā),貫穿林海松的整個(gè)博士生涯。在此次論文發(fā)表之前,他和當(dāng)時(shí)所在的團(tuán)隊(duì),已經(jīng)積累了相對(duì)充足的經(jīng)驗(yàn),并將階段性的技術(shù)整理為論文,以封面形式發(fā)表于Science Robotics。
 
  此后,研究人員一直在尋找和發(fā)掘更多的應(yīng)用場景,以將該技術(shù)最大化地用于日常生活。2020年,關(guān)于此次Nature論文的課題正式立項(xiàng)。
 
  但在當(dāng)時(shí),他們還迷茫于無法明確此類技術(shù)的最優(yōu)應(yīng)用價(jià)值。隨后新冠疫情爆發(fā),各領(lǐng)域?qū)<壹娂娂尤肟挂哧?duì)伍。作為相關(guān)領(lǐng)域的科研人員,該團(tuán)隊(duì)當(dāng)然也不例外。
 
  而對(duì)于已經(jīng)初步研發(fā)完畢的Ferrobot平臺(tái),課題組深諳其在生化檢測上的優(yōu)勢(shì),并立即意識(shí)到它將給病毒檢測帶來實(shí)際幫助。伴隨著疫情全球化的緊迫之感,他們開啟了為期兩年的研究。
 
  期間,一個(gè)具有革新意義的創(chuàng)意,讓該研究迎來了真正的關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)。正如前面說到,研究團(tuán)隊(duì)的最初目標(biāo)在于實(shí)現(xiàn)病毒個(gè)體樣本的檢測自動(dòng)化。不過,這一目標(biāo)在2021年初已被攻克。所以,他們并不滿足于當(dāng)時(shí)的自動(dòng)化檢測效率,總覺得Ferrobot的自動(dòng)化程度并沒有完全發(fā)揮出來。
 
  這時(shí)他們注意到,中國已經(jīng)開始使用核酸混檢方式。在人工混檢的背后,人力、物力的消耗不容小覷。一旦發(fā)現(xiàn)陽性,就要追溯同一混檢試管中的所有被檢人員,進(jìn)行一一重新排查。
 
  這讓研究人員意識(shí)到,病毒檢測需要根據(jù)當(dāng)?shù)夭《緜鞑コ潭?,來設(shè)計(jì)最優(yōu)的混檢篩查方法,而且最好是高自動(dòng)化的。而高適應(yīng)性的Ferrobot平臺(tái),是最有希望對(duì)該瓶頸進(jìn)行突破的手段之一。
 
  接下來的一年多里,核心成員們進(jìn)行著循環(huán)討論、實(shí)驗(yàn)和分析,這種一周7天、早7晚11的工作模式,大大加速了實(shí)驗(yàn)進(jìn)程,讓微流控芯片的設(shè)計(jì)及優(yōu)化、電路程序優(yōu)化、生物化學(xué)試劑兼容性等核心問題得以解決。

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(來源:Nature)
 
  而作為一款病毒檢測平臺(tái),自然要對(duì)真實(shí)樣本進(jìn)行大規(guī)模實(shí)驗(yàn)。課題組與加州大學(xué)洛杉磯分校(UCLA,University of California,Los Angeles)醫(yī)學(xué)院、以及其他實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行協(xié)調(diào)和求助,借此獲得大量的真實(shí)病毒樣本,最終對(duì)Ferrobot平臺(tái)進(jìn)行了臨床驗(yàn)證。
 
  結(jié)果顯示,對(duì)比日常的核酸檢測結(jié)果,其靈敏度和準(zhǔn)確性基本沒有差別。但是,F(xiàn)errobot平臺(tái)自動(dòng)化微流體平臺(tái)的特點(diǎn),能讓人力和物力的成本下降2-3個(gè)數(shù)量級(jí)。
 
  研究期間,在第一次對(duì)病毒個(gè)體樣本實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化檢測時(shí),擔(dān)任此次論文共同一作的余文卓,小心翼翼地從通風(fēng)櫥里把芯片拿出來,當(dāng)大家看到檢測結(jié)果和預(yù)期結(jié)果一致時(shí),那是科研人員最美好的瞬間。
 
  后來,當(dāng)看到準(zhǔn)確率非常接近現(xiàn)有標(biāo)準(zhǔn)方法時(shí),整個(gè)團(tuán)隊(duì)更加興奮,因?yàn)檫@意味著Ferrobot平臺(tái)兼具全自動(dòng)化和準(zhǔn)確性高的優(yōu)勢(shì)。
 
  科研有時(shí)就像“升級(jí)打怪”,總有更難的溝壑要越過。在個(gè)體檢測成功之后,課題組陷入了持續(xù)幾周的迷茫期——苦惱于如何對(duì)病毒檢測效率進(jìn)行突破性提升。
 
  為此,課題組向多個(gè)科研團(tuán)隊(duì)“取經(jīng)”,以了解關(guān)于病毒檢測的更多需求。在一次晚飯閑聊時(shí),有人偶然提到了前文的混檢模式。
 
  于是,林海松和余文卓開啟了一場激烈討論:如何利用Ferrobot平臺(tái)來優(yōu)化群組檢測效率。最終他們意識(shí)到:人工混檢中的很多問題,都有望通過該平臺(tái)達(dá)到更高的效率。
 
  為此,他們決定采用基于患病率的適應(yīng)性群組篩查算法:平方矩陣方案。林海松說:“記得那晚每個(gè)人都非常激動(dòng),對(duì)于項(xiàng)目的最終目標(biāo)‘摩拳擦掌’。哪怕現(xiàn)在想到當(dāng)時(shí)的情境,都會(huì)熱血沸騰。”
 
  而在實(shí)現(xiàn)對(duì)于群組篩查實(shí)驗(yàn)的全自動(dòng)化之后,當(dāng)?shù)谝淮卧趯?shí)驗(yàn)室看到測試結(jié)果真實(shí)地呈現(xiàn)在大家眼前時(shí)。“那一刻我們一片歡騰,也為所有組員全身心投入的這段艱辛攻堅(jiān)時(shí)期,畫上了圓滿的句號(hào)。”林海松表示。
 
  最終,相關(guān)論文以《鐵機(jī)器人群使可訪問且適應(yīng)性強(qiáng)的自動(dòng)化病毒測試成為可能》(Ferrobotic swarms enable accessible and adaptable automated viral testing)為題發(fā)表在Nature上[1]。
 
  林海松為第一作者和共同一作,UCLA電子與計(jì)算機(jī)工程系博士研究生余文卓、基亞拉什·薩貝特(Kiarash Sabet)是共同一作。通訊作者為UCLA電子與計(jì)算機(jī)工程系副教授薩姆·埃馬米內(nèi)賈德(Sam Emaminejad)和生物工程系教授迪諾·迪·卡洛(Dino Di Carlo)。

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圖|相關(guān)論文(來源:Nature)
 
  如今,林海松已經(jīng)離開美國,也離開了當(dāng)時(shí)的團(tuán)隊(duì),目前任職于香港大學(xué),但基于Ferrobot平臺(tái)的跨國合作仍會(huì)繼續(xù)。
 
  在科研層面,他們?nèi)栽诨贔errobot平臺(tái)尋找一些關(guān)鍵的生物化學(xué)標(biāo)記物,希望能對(duì)更多類型的人體健康狀況進(jìn)行評(píng)估,甚至對(duì)潛在疾病進(jìn)行預(yù)測。
 
  在成果轉(zhuǎn)化層面,在由香港大學(xué)機(jī)械工程系教授岑浩璋領(lǐng)導(dǎo)的先進(jìn)生物醫(yī)學(xué)研究中心(Advanced Biomedical Instrumentation Center)里,林海松最為相關(guān)項(xiàng)目負(fù)責(zé)人正嘗試把自動(dòng)化生物標(biāo)記的檢測技術(shù),推向更多外部實(shí)驗(yàn)室、醫(yī)院、以及檢測機(jī)構(gòu)。
 
  當(dāng)然,也在嘗試推向?qū)こ0傩占?,希望能讓人們通過幾滴唾液或汗液,就可以在電腦旁獲取自己的健康信息。另據(jù)悉,目前林海松課題組也在招募博士生、博士后和科研助理(linhs hku.hk)。
 
 
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