圖表示學(xué)習(xí)領(lǐng)域頂級(jí)科學(xué)家唐建創(chuàng)辦，下一代AI技術(shù)加速藥物研發(fā)進(jìn)程

 

　　百奧幾何由加拿大蒙特利爾大學(xué)算法研究所（Mila）的副教授、終身教授唐建博士于2021年創(chuàng)立，致力于開(kāi)發(fā)幾何深度學(xué)習(xí)、深度生成模型等下一代人工智能技術(shù)，用于大分子藥物研發(fā)。公司也獲得了圖靈獎(jiǎng)獲得者、深度學(xué)習(xí)三巨頭之一、加拿大蒙特利爾大學(xué)教授YoshuaBengio的認(rèn)可和支持，將擔(dān)任公司的科學(xué)顧問(wèn)。公司正打造人工智能大分子藥物設(shè)計(jì)和高通量大分子藥物濕實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證兩大基礎(chǔ)平臺(tái)，通過(guò)干濕實(shí)驗(yàn)閉環(huán)，快速完成候選藥物設(shè)計(jì)以及提高候選藥物在臨床階段的成功率。

 

　　計(jì)算能力的持續(xù)提高，加上高通量生物數(shù)據(jù)生產(chǎn)的指數(shù)級(jí)增長(zhǎng)，為科學(xué)家?guī)?lái)了藥物發(fā)現(xiàn)和開(kāi)發(fā)的新時(shí)代。從分子、蛋白質(zhì)到醫(yī)療知識(shí)圖譜，透過(guò)海量的圖結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)，AI模型和數(shù)據(jù)集在不斷改寫著生物制藥的格局。

 

　　百奧幾何創(chuàng)始人唐建博士畢業(yè)于北京大學(xué)信息科學(xué)學(xué)院，曾在微軟亞洲研究院擔(dān)任研究員，并在美國(guó)卡耐基梅隆以及密歇根大學(xué)進(jìn)行博士后研究。唐建博士在圖表示學(xué)習(xí)領(lǐng)域做了諸多開(kāi)創(chuàng)性的工作，也是國(guó)際上最早把深度學(xué)習(xí)運(yùn)用于圖結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)的少數(shù)幾名學(xué)者之一。

 

　　唐建博士曾獲得機(jī)器學(xué)習(xí)領(lǐng)域三大頂級(jí)會(huì)議ICML’14的最佳論文（國(guó)內(nèi)唯一）以及數(shù)據(jù)挖掘領(lǐng)域頂級(jí)會(huì)議WWW‘16的最佳論文提名。他在圖表示學(xué)習(xí)領(lǐng)域的代表性工作LINE2015年發(fā)表以來(lái)已經(jīng)被國(guó)內(nèi)外高校、工業(yè)界廣泛認(rèn)可，引用超過(guò)4500次。他多次擔(dān)任機(jī)器學(xué)習(xí)頂級(jí)會(huì)議ICML、NeurIPS的領(lǐng)域主席，并且多次獲得包括亞馬遜、騰訊等公司的教師科研獎(jiǎng)。

 

　　早在2018年，唐建博士在圖表示學(xué)習(xí)研究中意識(shí)到，最殺手級(jí)的應(yīng)用或?qū)⒄Q生在生物醫(yī)藥領(lǐng)域。唐建博士開(kāi)創(chuàng)性地把圖表示學(xué)習(xí)和幾何深度學(xué)習(xí)技術(shù)運(yùn)用到藥物研發(fā)領(lǐng)域，在分子性質(zhì)預(yù)測(cè)、結(jié)構(gòu)性質(zhì)預(yù)測(cè)上，進(jìn)行了大量創(chuàng)新性的研究工作。唐建博士領(lǐng)銜團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)了第一個(gè)專門針對(duì)藥物研發(fā)的開(kāi)源機(jī)器學(xué)習(xí)系統(tǒng)TorchDrug，旨在推進(jìn)人工智能在藥物發(fā)現(xiàn)方向的開(kāi)源共享，加速整個(gè)藥物研發(fā)的進(jìn)展，引起了廣泛關(guān)注。

 

　　AI大分子藥物設(shè)計(jì)平臺(tái)完成建設(shè)，抗體優(yōu)化、抗體結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)取得國(guó)際領(lǐng)先技術(shù)

 

　　目前，百奧幾何已基本完成人工智能大分子藥物設(shè)計(jì)平臺(tái)建設(shè)，在抗體結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)、抗體優(yōu)化、抗體序列設(shè)計(jì)、酶活性預(yù)測(cè)等任務(wù)上都取得了國(guó)際領(lǐng)先的水平。

 

　　公司的高通量大分子藥物濕實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證平臺(tái)，也正聯(lián)合生物醫(yī)藥領(lǐng)域知名高校和實(shí)驗(yàn)室展開(kāi)建設(shè)，推進(jìn)前沿工作。公司希望通過(guò)干濕實(shí)驗(yàn)閉環(huán)，加速藥物研發(fā)進(jìn)程。

 

　　與此同時(shí)，團(tuán)隊(duì)也聯(lián)合英偉達(dá)、英特爾、IBM等公司聯(lián)合發(fā)布了首個(gè)針對(duì)大分子藥物研發(fā)的開(kāi)源機(jī)器學(xué)習(xí)平臺(tái)TorchProtein。該平臺(tái)開(kāi)源了深度學(xué)習(xí)對(duì)大分子建模的一個(gè)通用框架、基于蛋白質(zhì)三維幾何結(jié)構(gòu)的第一個(gè)預(yù)訓(xùn)練大模型、以及專門用于評(píng)價(jià)深度學(xué)習(xí)對(duì)蛋白質(zhì)建模效果的標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)集。

 

　　團(tuán)隊(duì)目前已經(jīng)與國(guó)內(nèi)外多家著名高校、企業(yè)都建立了合作關(guān)系，共同推進(jìn)人工智能在藥物研發(fā)方向的進(jìn)展。

 

　　唐建博士表示，“當(dāng)前我們正處在AI以及生物技術(shù)革命的交匯點(diǎn)。一方面，幾何深度學(xué)習(xí)技術(shù)（如AlphaFold2）在分子建模方面取得了巨大突破；另一方面，以合成生物學(xué)為代表的生物技術(shù)能夠?qū)蜻M(jìn)行快速讀、寫、以及編輯，給AI創(chuàng)造了大量的數(shù)據(jù)。兩種革命技術(shù)的深度融合為生物大分子設(shè)計(jì)帶來(lái)了巨大的機(jī)會(huì)。”

 

　　高榕資本創(chuàng)始合伙人岳斌表示，“計(jì)算領(lǐng)域的突破，正在重構(gòu)藥物發(fā)現(xiàn)的過(guò)程。我們相信，人工智能可以幫助大分子藥物研發(fā)取得很大的進(jìn)展。唐建博士將圖表示學(xué)習(xí)和幾何深度學(xué)習(xí)技術(shù)運(yùn)用到藥物研發(fā)領(lǐng)域，做了非常多開(kāi)創(chuàng)性的工作，也在抗體優(yōu)化、抗體結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)任務(wù)上取得了國(guó)際領(lǐng)先的技術(shù)。期待百奧幾何通過(guò)下一代人工智能技術(shù)，加速藥物研發(fā)進(jìn)程，解決重大疾病挑戰(zhàn)。”